มหาวิทยาลัยตรูโนโจโยมาดูรา (University of Trunojoyo Madura, ชื่อภาษาอินโดนีเซีย: Universitas Trunojoyo Madura) ตั้งอยู่บนเกาะมาดูรา จังหวัดชวาตะวันออก ประเทศอินโดนีเซีย นับตั้งแต่ปี 2001 มหาวิทยาลัยได้เปลี่ยนสถานะจากเดิมที่เป็นมหาวิทยาลัยเอกชนภายใต้ชื่อบังกาลันมาดูรา มาเป็นมหาวิทยาลัยรัฐ เพื่อตอบสนองความต้องการของชุมชนชาวมาดูรีสในพื้นที่ มหาวิทยาลัยแห่งนี้ประกอบด้วยคณะต่างๆ จำนวน 7 คณะ ได้แก่ นิติศาสตร์ เศรษฐศาสตร์และพาณิชยศาสตร์ วิศวกรรมศาสตร์ เกษตรศาสตร์ อิสลามศึกษา ศึกษาศาสตร์และการฝึกหัดครู และสังคมศาสตร์และรัฐศาสตร์

มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์ได้ทำบันทึกความเข้าใจว่าด้วยความร่วมมือทางวิชาการกับมหาวิทยาลัยตรูโนโจโยมาดูราในปี 2017 และมีกิจกรรมร่วมกันหลากหลายกิจกรรมเพื่อเสริมสร้างความร่วมมือระหว่างกัน กิจกรรมเช่นค่ายฤดูร้อนอาเซียนเป็นโครงการที่จัดโดยมหาวิทยาลัยตรูโนโจโยมาดูราสำหรับนักศึกษาจากมหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์ เพื่อเรียนรู้ภาษาอินโดนีเซียขั้นพื้นฐานและวัฒนธรรมมาดูรีส รวมถึงการจัดทัศนศึกษาระยะสั้นเพื่อไปเยี่ยมชมสถานที่สำคัญๆ ของประเทศอินโดนีเซีย มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์ยังเป็นเจ้าภาพรับนักศึกษาจากมหาวิทยาลัยตรูโนโจโยมาดูและมอบหมายให้อาจารย์ของมหาวิทยาลัยทำหน้าที่เป็นอาจารย์ที่ปรึกษาสำหรับการพัฒนาโครงงานก่อนจบการศึกษา รวมทั้งเปิดโอกาสให้นักศึกษาชาวอินโดนีเซียได้เรียนรู้วัฒนธรรมไทยผ่านกิจกรรมต่างๆ ร่วมกับนักศึกษาไทย

นอกเหนือจากนี้ คณาจารย์บางส่วนจากมหาวิทยาลัยตรูโนโจโยมาดูรายังได้มาเยือนมหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์ในฐานะนักวิชาการรับเชิญและทำหน้าที่ให้ความช่วยเหลือในการพัฒนาข้อสอบมาตรฐานภาษาอินโดนีเซีย ร่วมเขียนบทความทางวิชาการกับอาจารย์ของสำนักวิชา ทั้งยังร่วมพัฒนาสื่อการเรียนการสอนภาษาอินโดนีเซียที่จะใช้กับนักศึกษาของสำนักวิชาด้วยเช่นกัน